ด้านล่างนี้เป็นตารางสรุปเหรียญโอลิมปิกฤดูร้อน 2016 ตามการนับเหรียญของคณะกรรมการโอลิมปิกสากล อันดับเหล่านี้เรียงตามจำนวนเหรียญทองที่คณะกรรมการโอลิมปิกแห่งชาติได้รับ จำนวนเหรียญเงินจะถูกพิจารณาเป็นลำดับถัดไป และสุดท้ายเป็นจำนวนเหรียญทองแดง หากเท่ากันทั้งเหรียญทอง เงินและทองแดง จะมีการให้อันดับเท่ากันและจะลงรายการตามตัวอักษรตามรหัสประเทศคณะกรรมการโอลิมปิกสากล แม้คณะกรรมการโอลิมปิกสากลจะให้สารสนเทศข้างต้นนี้ แต่คณะกรรมการฯ เองไม่ได้รับรองหรืออนุมัติระบบจัดอันดับใด ๆ[7]

• ในกีฬามวยสากล (13 ประเภท) ยูโด (14) เทควันโด (8) และมวยปล้ำ (18) จะมีการมอบเหรียญทองแดงให้สองเหรียญในแต่ละขั้นน้ำหนัก (รวมเหรียญทองแดงเพิ่มเติม 53 เหรียญ)

• มีการมอบสองเหรียญทอง ในรายการว่ายน้ำฟรีสไตล์ 100 เมตร หญิง โดยไม่มีผู้ที่ได้รับเหรียญเงิน

• มีการมอบสามเหรียญเงิน ในรายการว่ายน้ำผีเสื้อ 100 เมตร ชาย โดยไม่มีผู้ที่ได้รับเหรียญทองแดง

• มีการมอบสองเหรียญทองแดง ในรายการว่ายน้ำกรรเชียง 100 เมตร หญิง